INFOTEC participa activamente en el programa de laboratorios nacionales de CONACYT con el Laboratorio Nacional de Internet del Futuro (LaNIF). Además, ha constituido dos más con sede en INFOTEC Aguascalientes: el Laboratorio de Analítica Computacional de Grandes Cúmulos de Información (LABD), el Laboratorio de Sistemas Embebidos (LabSE).